Климат континентальный. Средние температуры января -2°С, июля 20°С. Осадков 300-600 миллиметров в год. Важный транспортный узел. Железнодорожная станция на линии Ульяновск - Челябинск. Автомагистраль Самара - Челябинск и другие автодороги. Имеется аэропорт.
До середины XVI века на месте так называемой Старой Уфы существовало древнее ногайское укреплённое поселение Туратау (в русских источниках - Чёртово городище). В 1574 году здесь при слиянии рек Белая и Уфа была основана крепость Уфа, которая в 1586 году получила статус города. В XVII веке Уфа - крупный торговый центр на путях из Центральной России в Сибирь. С 1708 года Уфа в составе Казанской губернии, в 1728-1744 годах центр самостоятельной провинции, воевода которой подчинялся непосредственно Сенату. В 1744 году Уфа вошла в состав Оренбургской губернии. В 1773-1774 годах выдержала 4-месячную осаду войск Е.И. Пугачёва под командованием Чики (И.Н. Зарубина). В 1788 году в Уфе было создано Духовное управление мусульманами всей России (кроме Таврической губернии) во главе с муфтием. С 1781 года Уфа центр Уфимского наместничества, с 1796 года в составе Оренбургской губернии, с 1865 года центр Уфимской губернии.
К 70-м годам XIX века было установлено постоянное пароходное сообщение по реке Уфе и реке Белой. В 1890 году через город прошла Самаро-Златоустовская железная дорога. Во 2-й половине XIX века в Уфе начала развиваться промышленность; к 1897 году в городе действовали 29 фабрик и заводов (машиностроительный, чугуномеднолитейный, лесопильные, кирпичные, пивоваренные и другие); значительное место занимали переработка сельскохозяйственного сырья и торговля хлебом и лесом; проводились зимние ярмарки.
В Уфе родились писатель С.Т. Аксаков (в 1959 году в городе установлен ему памятник, скульптор Т.П. Нечаева), художник М.В. Нестеров; с городом тесно связана жизнь национального героя Башкирии Салавата Юлаева (установлен памятник, 1967 год, скульптор С.Д. Тавасиев), Героя Советского Союза А.М. Матросова (установлен памятник, 1951 год, скульптор Л.Ю. Эйдлин).
В современной Уфе ведущие отрасли промышленности - нефтеперерабатывающая промышленность (Уфа самый крупный в России центр нефтепереработки), химическая промышленность и нефтехимическая промышленность (производство продуктов основного органического синтеза, резинотехнических изделий), машиностроение и металлообработка (Производственное объединение моторостроительное, Производственное объединение «Электроаппарат», Производственное объединение «Металлист»; машиностроительный завод, кабельный завод, электроламповый завод, завод горного оборудования, завод пишущих машинок и другие предприятия). Развита лёгкая промышленность, пищевая промышленность (витаминный завод), производство строительных материалов.
Действует Научно-исследовательский институт Башкирского филиала Российской Академии наук (включает институт геологии, институт биологии, институт химии, институт истории, институт языка и литературы; отдел экономических исследований, отдел физики и математики, отдел биохимии и цитохимии), Научно-исследовательский институт нефтеперерабатывающей, нефтехимической промышленности.
Действует Башкирский государственный университет, Авиационный технический университет, медицинский институт, педагогический институт, сельскохозяйственный институт, институт искусств, нефтяной институт; факультеты Всероссийского заочного финансово-экономического института, филиал Московского коммерческого университета, филиал Государственной академии сферы услуг и быта, филиал Российского заочного ин-та текстильной и лёгкой промышленности.
Работает театр драмы имени М. Гафури, театр оперы и балета, Русский драматический театр, театр кукол, филармония, цирк, мотодром, планетарий, Башкирский краеведческий музей (основан в 1864 году), Художественный музей имени М.В. Нестерова (основан в 1919 году; в основе художественного собрания - коллекция М.В. Нестерова, подаренная им городу; доставлена в Уфу в 1920 году), дом-музей В.И. Ленина (посетил Уфу в 1900 году) и дом-музей башкирского поэта М. Гафури.
Город расположен на возвышенном мысу (так называемый Уфимский полуостров) между рекой Белая и её притоком рекой Уфа. Первоначальная застройка в исторической части Уфы осуществлялась по радиальным направлениям от острога-кремля (существовал до начала XIX века); по регулярному плану 1803-1819 годов город застраивался прямоугольными кварталами (преимущественно деревянными малоэтажными домами), с расширением к северу и западу и ориентацией на главные площади города базарную с каменным Гостиным двором (1-я треть XIX века) и Соборную.
Среди сохранившихся культовых сооружений: Троицкая церковь (конец XVI века, горела в 1796 году), входящая в композицию Смоленского собора (так называемая тёплая церковь, или трапезная, построена в 1824 году; колокольня высота 26 метров, 1779 год); несколько храмов в стиле классицизма - Покровская церковь (1823) на правом берегу Сутолки, Спасская церковь (1824), магометанская мечеть (1830) возле реки Белая, кафедральный собор (1841). К памятникам гражданской каменной архитектуры 1-й половины XIX века в стиле классицизма относятся: Архиерейский дом над обрывом реки Белая с садом и террасой; 3-этажная с фронтоном духовная семинария (ныне сельскохозяйственный институт) у центрального парка; мужская гимназия (ныне медицинский институт, надстроена в 1936 году) с боковыми флигелями, недалеко от неё располагаются губернаторский дом, Дворянское собрание (ныне Публичная библиотека).
По генеральному плану 1886 года было осуществлено широкое озеленение и благоустройство города, в период строительного подъёма конца XIX - начала XX веков - оформление городского центра административно-общественными и жилыми зданиями в стиле модерн: особняки Поносовой-Модло (ныне Институт истории, языка и литературы), Кастерина (ныне Министерство сельского хозяйства), Лаптева (ныне Художественный музей), губернская земская управа, Городская дума, Крестьянский банк (1909 год, с элементами псевдороманского стиля), Народный дом С.Т. Аксакова (1908-1920-е годы, архитектор П.П. Рудаковский, ныне Театр оперы и балета имени М. Гафури).
В 1920-е годы в стиле конструктивизма возведены несколько 5-этажных жилых домов на главных улицах, в 1930-1940-е годы в формах неоклассицизма построены монументальное здание «Башсоюза» и управления связи, Совет Министров (1937), Дом промышленности (со шпилем в центре композиции), ряд жилых домов, гостиница «Башкирия» (1941), Университет, республиканская библиотека, Училище искусств, Медицинский институт и Авиационный институт, Театр драмы и другие здания и сооружения; осуществлялось интенсивное промышленное строительство в северной части города и строительство новых жилых районов.
В 1950-е годы оформлены общественные центры новых северных районов, начала развиваться заречная часть города. В 1960-1970-е годы созданы новые продольные транспортные магистрали, связавшие южную и северную части Уфы, введены современные принципы планировки с чередованием открытых и закрытых пространств, контрастом многоэтажных домов и пластичных объёмов общественных центров.
На юго-западной окраине Уфы находится древний курган и селище; на правом берегу Дёмы, у железной дороги, находится городище (гора «Висячий камень»).
В 55 километрах к западу от Уфы, возле деревни Нижние Термы, находятся остатки дворца Тура-хана XIV-XV веков, 24-угольного в плане, со скошенными углами и пирамидальной кровлей на своде.
В 50 километрах к западу от Уфы, близ станции Чишмы Южно-Уральской железной дороги и озера Акзырат, находятся остатки мавзолея Хусаин-бека, 1-го проповедника ислама в Башкирии (4-угольное в плане здание со сводом на тромпах).
Население: 50 000 (1897), 99 000 (1926), 258 000 (1939), 547 000 (1959), 771 000 (1970), 969 000 (1979), 1 097 200 (1992).